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猪的抗菌药物耐药性高于欧洲肉鸡


现代畜牧网 http://www.nongzhong5083.com 2019/3/15 10:54:23 关注:329 评论: 我要投稿

  迄今为止,在对生产动物进行的最大宏基因组学研究中,丹麦技术大学发现猪的抗菌药物耐药性比肉鸡更高,但肉鸡的耐药基因种类更多。用抗微生物剂处理动物会导致细菌变得耐药,这些抗性细菌可以通过食物链传播给人类并与动物紧密接触。显示抗生素抗性存在的位置,类型和数量的可靠数据对于对抗动物中的抗性细菌以及评估旨在限制抗微生物抗性存在的政治举措的效果是必要的。
  猪的抗菌药物耐药性高于欧洲肉鸡
  这就是丹麦通过DANMAP监测计划监测抗生素耐药性和在生产动物和人类中使用抗生素20多年的原因。然而,目前的监测方法仅显示冰山一角,因为它们基于分离和生长特定的致病微生物并确定特异性地在这些生物体中发生抗微生物抗性。
  新方法产生了巨大的数据集
  另一方面,宏基因组测序可以提供更详细的抗性程度图,因为该方法可以绘制样品中的所有DNA材料,而不仅仅是选定的生物体。因此,研究人员可以检测到生物体中的抗性,而这些物质并不存在。
  丹麦技术大学国家食品研究所的研究人员领导了迄今为止最大的生产动物宏基因组学研究,他们与其他欧洲研究人员一起制定了欧洲猪和肉鸡的抗药性程度和类型。
  研究人员使用DTU超级计算机Computerome分析了来自9个欧洲国家359个农场的9,000多头猪和肉鸡的粪便样本中的DNA序列。这导致超过5,000亿个DNA核苷酸的测序,相当于超过1,500个人类基因组。
  这两个众所周知且令人惊讶的结果
  “正如之前对个别细菌种类的研究所见,我们发现消费与抵抗之间存在相关性。因此,我们不出所料地发现丹麦和荷兰农场的抗药性较低,农民使用的抗菌药物数量低于其他7个国家。”国家食品研究所的博士后Patrick Munk说。
  “然而,令人惊讶的是,虽然我们发现猪的抗性比肉鸡更多,但肉鸡的抗性基因存在更大的差异。我们还看到各国之间的抗性谱差异很大,这是由于抗菌药物使用的差异,细菌成分的差异以及其他未知因素,“他补充说。
  研究人员还能够利用研究结果确定选定的,有问题的抗性基因如mcr-1 的扩散,这些基因会导致对抗菌粘菌素的抗性。分析表明,mcr-1最常见于保加利亚和意大利肉鸡。
  宏基因组研究显示出很多潜力
  与传统的分析方法不同,宏基因组学研究的原始数据可以在将来重复使用,以检验其他问题。随着研究人员检测到更多的抗性基因,这将使他们能够从旧的宏基因组测序研究中回收原始数据,以了解这些基因是如何出现和传播的。
  “生产动物的宏基因组数据的数字档案具有重要价值,因此我们建议除现有的常规抗药性监测外,还应引入基于宏基因组测序的抗性监测方法,”Patrick Munk说。
  该研究是与欧盟资助的项目EFFORT的同事合作进行的。结果在“ 自然微生物学 ” 杂志的一篇科学文章中进一步详细描述:“ 九个欧洲国家的屠宰猪和肉鸡的粪便抵抗组的丰富和多样性”。
  该研究的样本来自比利时,保加利亚,丹麦,法国,德国,意大利,荷兰,波兰和西班牙。
文章来源:网络     文章编辑:一米优讯     
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